Antibiotics have been a critical public health tool since the discovery of Penicillin in 1928, saving the lives of millions of people around the world. In developing country like ours, where the burden of treatable disease is very high and access to health facilities and laboratories is difficult, a...ntibiotics have long acted as miracle drugs. Today, however, the emergence of drug
resistance in bacteria is reversing the miracles of the past eighty years, with drug choices for the treatment of many bacterial infections becoming increasingly limited, expensive, and in some cases, nonexistent. Diseases previously regarded as relatively easy to manage are much harder to treat as doctors must use “last-resort” drugs that are more costly, take longer to work
and are often unavailable or unaffordable in developing countries. Moreover, regular prescription of antibiotics, random treatment, over the counter sales, inadequate dosage, inclusion of antibiotics in animal feeds and agriculture has contributed equally to emergence of antibiotics resistance as silent epidemic within the country.
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In 2009, WHO’s Second International Conference on Buruli Ulcer Control and Research resolved to strengthen the capacity of national laboratories to confirm cases of the disease, but advised that “efforts are still needed to develop simple diagnostic tools usable in the field as well as disabilit...y prevention methods”.
In 2013, WHO and the Foundation for Innovative New Diagnostics convened a meeting of Buruli ulcer experts in Geneva, Switzerland (9) at which two priority unmet needs in diagnosis were identified:
a diagnostic test for early detection of Buruli ulcer in symptomatic patients with sufficient positive predictive value to put patients on appropriate treatment; and
a screening test at the primary health care or community level for symptomatic patients with ulcer
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The WHO guidelines provide recommended steps for safe phlebotomy and reiterate accepted principles for drawing, collecting blood and transporting blood to laboratories/blood banks.
he Framework sets the requirements for facilities handling High Consequence Agents and Toxins (HCATs) and guides the implementation of laboratory biosafety and biosecurity practices associated with the design, commissioning, routine operation safe and secure biocontainment laboratories.
Africa CDC Institute of Pathogen Genomics (IPG) was launched in November 2019 and operates under the Division of Laboratory Systems and Networks.
IPG coordinate the implementation of molecular diagnostics, pathogen genomics and bioinformatics in National Public Health Institutions (NPHIs) and/or Re...fe-
-rence Laboratories (NRLs) across Africa.
Africa CDC and APHF are coordinating a continental initiative to maximize the benefits of molecular approaches and pathogen genomics for more effective
outbreak preparedness, prevention, response, and for the control and elimination of endemic diseases in Africa. One of Africa CDC’s flagship initiative is the Africa
Pathogen Genomics Initiative (Africa PGI), a partnership that aims to strengthen laboratory systems and enhance genomic surveillance by equipping the continent’s
public health institutions with the tools, training, and data infrastructure.
About the Project
In 2023, 166 outbreaks and public health events were reported in Africa. This calls for a resilient laboratory systems for timely detection and reporting of current and future outbreaks. This project aims to scale up molecular diagnostic and genomic sequencing-based detection and characterization of outbreaks.
Africa CDC is working with Member States to develop guidance, diagnostic algorithm, training and capacity building to enable outbreak detection, and reporting to inform public health response.
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Representative, quality, timely and continuous genetic surveillance of SARS-CoV-2 is critical to the COVID-19 outbreak response. This document provides practical guidance to Global Influenza Surveillance and Response System (GISRS) laboratories and other relevant national laboratories to move beyond... virus detection to genomic sequencing of SARS-CoV-2 PCR positive materials obtained from sentinel surveillance of influenza-like illness (ILI), acute respiratory infection (ARI) and severe acute respiratory infection (SARI). It contains considerations on sample selection for sequencing, numbers of viruses to be sequenced, metadata and timeliness for sharing genetic sequence data (GSD) and opportunities for technical support.
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Many in-house and commercial assays that detect the COVID-19 virus have been developed or are currently under development. Many of these molecular assays are currently being validated in partner laboratories. An overview of assays that have applied to FIND for participation in their assay assessment... work can be found here
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The current document is anupdate of the guidelines developed by the EUCAST subcommittee on detection of resistance mechanisms. The EUCAST Steering Committee has carried out the current update. The document has been developed mainly for routine use in clinical laboratories and doesnot cover technical... procedures for identification of resistance mechanisms at a molecular level by reference or expert laboratories. However, much of the content is also applicable tonational reference laboratories. Furthermore, it is important to note that the document does not cover screening for asymptomatic carriage (colonization) of multidrug-resistant microorganismsor direct detectionof resistancein clinical samples.
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Module 10
Testing providers
July 2017
Module 10: Testing providers. This module is for people who provide testing services at PrEP sites and laboratories. It offers guidance in selecting testing services, including screening of individuals before PrEP is initiated and monitoring while they ar...e taking PrEP. Information is provided on HIV testing, creatinine, HBV and HCV, pregnancy and STIs.
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The National Guidelines for HIV-1 Viral Load Laboratory Testing support plans to scale up viral load (VL) testing to reach the 90-90-90 targets in India. This phased scale-up includes the setup of 70 additional VL testing laboratories nationally. These guidelines include laboratory design considerat...ions, a summary of VL technologies, and specimen collection and handling as well as transportation and storage guidance. Quality control and quality assurance requirements are described as well as laboratory safety issues. The guidelines also describe the VL laboratory network to be developed with supply chain management issues and commodities described. Annexes include laboratory registers and reporting forms.
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The PIP Framework is premised on two equally important public health objectives:
-to ensure the sharing of influenza viruses with human pandemic potential through a WHO coordinated network of public health laboratories called the “Global Influenza Surveillance and Response System” (GISRS), and...
-to promote the fair and equitable access to benefits, such as vaccines and antiviral medicines, that arise from such sharing.
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2ª edição atualizada.
O Manual de Recomendações apresenta as diretrizes nacionais para o controle da doença, que incluem procedimentos clínicos padronizados, procedimentos laboratoriais, sistema de vigilância, ações de biossegurança e organização de serviços. Apesar de conter as reco...mendações clínicas no que diz respeito à padronização de ações de busca de casos e tratamento, o manual está destinado às ações voltadas para a saúde pública e não pretende ser um guia clínico sobre a doença. Dessa forma, não substitui livros, textos e publicações acadêmicas que identifiquem boas práticas clínicas sobre a abordagem do sintomático respiratório e do paciente com tuberculose nos seus variados aspectos e especificidades.
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O recente aumento dos casos de microcefalia e outras patologias neurológicas potencialmente associadas à infecção pelo vírus Zika provocou um aumento da procura de testes laboratoriais para detectar a infecção. Os grupos prioritários para os testes de diagnóstico devem ser
indivíduos sin...tomáticos e mulheres grávidas assintomáticas com possível exposição ao vírus Zika. O presente documento fornece orientações sobre as actuais estratégias de testes da infecção pelo vírus Zika. Este documento será revisto e actualizado à medida que surgirem novas informações.
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The Emergency Access Initiative (EAI) has been activated in support of medical efforts related to the Ebola Outbreak in West Africa. The Emergency Access Initiative is a col-
laborative partnership between the U.S. National Library of Medicine and participating publishers to provide free access to ...full text articles from over 650 biomedical serial Titles and over 4,000 reference books and online databases to healthcare professionals and libraries affected by disasters. The free access period is now to December 12, 2014
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La détection directe des protéines virales du SRAS-CoV-2 (antigènes) dans les écouvillons nasaux et autres sécrétions respiratoires à l'aide de tests immunologiques à flux latéral (également appelés tests de diagnostic rapide, TDR) offre une méthode plus rapide et moins coûteuse pour te...ster le SRAS-CoV-2 que la méthode de référence, les tests d'amplification des acides nucléiques (TAAN). Ces lignes directrices provisoires offrent des recommandations sur les utilisations prioritaires des tests de diagnostic rapide à détection d'antigène (TDR-Ag) dans des populations et des contextes spécifiques, notamment (i) pour la détection primaire des cas chez les personnes symptomatiques suspectées d'être infectées et les personnes asymptomatiques à haut risque de COVID-19, (ii) pour la recherche des contacts, (iii) pendant les enquêtes sur les épidémies et (iv) pour surveiller les tendances de l'incidence de la maladie dans les communautés. Les TDR-AG répondant aux exigences minimales de performance peuvent être utilisés en dehors des milieux cliniques et des laboratoires, y compris dans les communautés, par des opérateurs formés conformément aux instructions. Le guide fournit en outre des recommandations sur la mise en œuvre, la sélection des produits et le stockage
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Ce rapport présente les résultats clés de la quatrième Enquête Démographique et de Santé du Bénin (EDSB-IV), qui a été réalisée de décembre 2011 à mars 2012 par l’Institut National de la Statistique et de l’Analyse Économique (INSAE) sous la tutelle du Ministère du Développement..., de l’Analyse Économique et de la Prospective, en collaboration avec les services techniques du ministère de la Santé, le Programme National de Lutte contre le Sida (PNLS), le Laboratoire de Parasitologie du Centre National Hospitalier et Universitaire Hubert Maga (CNHU) et le Laboratoire de référence du Programme National de Lutte contre le Sida et les IST (PNLS). L’EDSB-IV a été financée par le Gouvernement du Bénin, l’Agence des États-Unis pour le Développement International (USAID), le Fonds Mondial, le Fonds des Nations Unies pour l’Enfance (UNICEF), le Fonds des Nations Unies pour la Population (UNFPA) et le Programme Multisectoriel de Lutte contre le Sida (PMLS) par le biais d’un financement de la Banque Mondiale.
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Procédures de gestion clinique standard.
La maladie à virus Ebola (MVE) est une maladie multisystémique potentiellement mortelle qui entraîne souvent une hypovolémie, une acidose métabolique, une hypoglycémie et une défaillance multi-viscérale. L'épidémie prolongée de MVE en Afrique de... l'Ouest en 2013-2016 a permis une évolution dans le domaine des soins telle qu'à la fin de l'épidémie, de nombreux patients ont pu recevoir des soins de support individualisés et optimisés, dont la réanimation hydro-électrolytique, le contrôle des symptômes, la surveillance biologique en laboratoire et au chevet de la glycémie et des électrolytes, la prise en charge des défaillances d’organe, ainsi que la détection et le traitement rapides des co-infections, contribuant ainsi à une réduction de la mortalité.
Toutefois, le niveau des soins varie considérablement d'un centre de traitement Ebola (CTE) à l'autre, au cours de la même épidémie, ainsi que d’une épidémie à l’autre
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Principaux faits
D’après les estimations, 6 à 7 millions de personnes dans le monde sont infectées par Trypanosoma cruzi (T. Cruzi), le parasite responsable de la maladie de Chagas. La plupart de ces personnes vivent en Amérique latine.
La transmission à l’être humain se fait principalem...ent, en Amérique latine, par l’intermédiaire d’un insecte appelé triatome, qui peut être porteur de T. cruzi.
Parmi les autres modes de transmission de la maladie de Chagas, figurent : la transmission orale (par voie alimentaire), la transfusion de sang ou de produits sanguins, la transmission mère-enfant (congénitale), la transplantation d’organes et les accidents de laboratoire.
La maladie de Chagas ne touchait auparavant que des zones rurales de la Région des Amériques, et surtout de l’Amérique latine. Ces dernières décennies, toutefois, les mouvements de population ont fait que la plupart des personnes infectées sont des habitants de zones urbaines (urbanisation) et que la maladie s’est propagée à d’autres continents (où T. cruzi se transmet par des voies non vectorielles).
L’infection à T. cruzi est curable si un traitement est instauré rapidement après l’infection.
Chez les personnes infectées de façon chronique, un traitement antiparasitaire peut éventuellement prévenir ou enrayer la progression de la maladie, et éviter sa transmission, notamment de la mère à l’enfant.
Jusqu’à 30 % des personnes infectées de façon chronique présentent des troubles cardiaques, et jusqu’à 10 % d’entre elles souffrent de troubles digestifs et/ou neurologiques, ce qui peut imposer un traitement particulier.
Les principales méthodes de prévention de la maladie de Chagas en Amérique latine sont la lutte antivectorielle ainsi que d’autres stratégies visant à réduire la transmission vectorielle.
Dans le monde entier, le dépistage sanguin joue un rôle crucial dans la prévention de l’infection par transfusion ou transplantation d’organes.
Il est essentiel de détecter et de traiter l’infection chez les femmes et les filles en âge de procréer, ainsi que de soumettre tout nouveau-né et ses frères et sœurs à un dépistage dans le cas où la mère est infectée et n’a jamais reçu de traitement antiparasitaire.
Certains facteurs socio-économiques et environnementaux influent fortement sur la maladie de Chagas, dont la propagation et les différentes dimensions interdépendantes justifient la nécessité de mettre en œuvre des stratégies de lutte multisectorielles.
Quelques pays ont mis en place la notification et la surveillance des cas aigus et chroniques et des voies de transmission actives, qui sont essentielles à la lutte contre la maladie de Chagas.
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Ce rapport présente les principaux résultats de la quatrième édition de Enquête Démographique et de Santé du Bénin
(EDSB-IV), réalisée de décembre 2011 à mars 2012 par l’Institut National de la Statistique et de l’Analyse
Économique (INSAE) sous la tutelle du Ministère du Dévelo...ppement, de l’Analyse Économique et de la
Prospective, en collaboration avec les services techniques du ministère de la Santé, le Programme National de Lutte
contre le Sida (PNLS), le Laboratoire de Parasitologie du Centre National Hospitalier et Universitaire Hubert Maga
(CNHU) et le Laboratoire de référence du Programme National de Lutte contre le Sida et les IST (PNLS).
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À l’heure où des techniques innovantes de dépistage sur le lieu de soins (POC) sont mises sur le marché, le présent rapport soumet à l’attention des gouvernements un examen des principaux aspects relatifs à leur introduction et à leur extension au sein des programmes publics nationaux. L...’élargissement de la portée de cette stratégie aux réseaux nationaux de dépistage des laboratoires conventionnels contribuerait à la réalisation des objectifs d’accélération de la riposte visant à mettre fin à l’épidémie de sida d’ici à 2030.
Le dépistage sur le lieu de soins, lorsqu’il est stratégiquement mis en place et intégré dans les réseaux nationaux de dépistage, peut contribuer à promouvoir des changements et à améliorer la prestation des services cliniques et de dépistage. Le présent document s’inspire de l’expérience acquise en matière d’introduction, par le biais de financements catalysateurs, de techniques de dépistage sur le lieu de soin dans les programmes et les marchés de nombreux pays d’Afrique subsaharienne pour défendre ce point de vue.
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