Of the more than 10 million people estimated to have fallen ill with tuberculosis (TB) in 2022, just over 400 000 people developed TB resistant to rifampicin (RIF), and 1.3 million people developed TB resistant isoniazid (INH). Drug resistance must be detected rapidly and accurately to initiate appr...opriate and effective treatment.
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A COVID-19 virus mutation tracker system (CovMT; appendix) based on SARS-CoV-2 isolate genomes deposited to GISAID to track the worldwide sequencing efforts and the evolution of the mutational landscape of this virus. CovMT, which is updated daily, summarises mutations from more than 450 000 isola...tes into groups of generic virus clades, lineages, and more specific mutation sets we call mutation fingerprints.
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The NY Times variant tracker is perhaps the most accessible and relevant publication for non-molecular biologists and the general public
Each coronavirus contains nearly 30,000 letters of RNA. This genetic information allows the virus to infect cells and hijack them to make new viruses.
Lorsqu’un virus circule largement dans une population et entraîne de nombreuses infections, la probabilité de mutation augmente. Plus un virus a de possibilités de se propager, plus il se réplique – et plus il est susceptible de muter. En savoir plus sur les causes de la mutation d’un vi...rus. Grâce aux notes explicatives de l’OMS sur les vaccins, en savoir plus sur les vaccins, sur leur fonctionnement et sur la façon dont ils sont fabriqués pour en garantir l’innocuité et y permettre un accès équitable.
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Lorsqu’un virus circule largement dans une population et entraîne de nombreuses infections, la probabilité de mutation augmente. Plus un virus a de possibilités de se propager, plus il se réplique – et plus il est susceptible de muter. L’arrêt de la propagation du virus à la source res...te essentiel. Les mesures actuelles visant à réduire la transmission du virus – dont le lavage fréquent des mains, le port du masque, la distanciation physique et le fait d’éviter de se rendre dans les lieux très fréquentés ou fermés – restent efficaces contre les nouveaux variants car elles réduisent la transmission du virus, qui a donc moins de possibilités de muter. Grâce aux notes explicatives de l’OMS sur les vaccins, en savoir plus sur les vaccins, sur leur fonctionnement et sur la façon dont ils sont fabriqués pour en garantir l’innocuité et y permettre un accès équitable.
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Les maladies infectieuses sont en constante mutation. De nouvelles maladies apparaissent, d’autres qui sont bien connues se propagent ou refont surface, et quelques rares fois, une maladie est éradiquée. Les maladies infectieuses telles que le VIH, la tuberculose et le choléra sont des causes c...onsidérables de morbidité et de mortalité dans plusieurs régions du monde. Le personnel de la santé joue un rôle primordial, en ce qui concerne la protection de leurs clients contre les maladies infectieuses et leurs traitements en cas d’infection. Dans le cadre de leur travail, le personnel de santé accomplisse des tâches cliniques ou autres activités susceptibles de les exposer ainsi que leurs clients aux microorganismes – orga- nismes potentiellement infectieux. Bon nombre de ces clients sont malades et, par conséquent, sont plus vulnérables aux infections ou peuvent avoir des infec-tions susceptibles d’être transmises à d’autres personnes. Par chance, l’ensemble du personnel travaillant dans les services de santé est en mesure d’exécuter des procédés simples visant à minimiser le risque – vis-à-vis d’eux-mêmes et de leurs clients – et réduire la propagation des infections. Ces pratiques peuvent être intégrées à moindre frais dans les habitudes quotidiennes au sein des établissements de santé du monde entier. Ce guide de référence est spécialement conçu pour l’emploi à tous les niveaux du système sanitaire, depuis les plus grands hôpitaux jusqu’aux plus petits dispensaires ou centres de santé, dans des établissements où les ressources sont rares.Ce guide, publié pour la première fois en 1999, a été mis à jour. Bien que la plu-part des pratiques restent inchangées, il a fait l’objet de quelques modifications significatives – par exemple, concernant les recommandations liées au lavage des mains et aux précautions standard. Toutefois, ce guide continue de présenter des recommandations pratiques en matière de procédés simples et relativement peu coûteux pouvant être exécutés partout, à l’aide des matériels de base et des équi-pements de niveau technologique moyen.
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Antibiotic resistance is a natural occurrence caused by mutations in bacteria’s genes. However, inappropriate use of antibiotics accelerates the emergence and spread of antibiotic-resistant bacteria. When exposed to antibiotics, susceptible bacteria are killed; while excessive antibiotic use or th...eir use for the wrong reasons can cause bacteria to become resistant and continue to grow and multiply. These resistant bacteria may spread and cause infections in other people.
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This document provides practical guidance on planning and implementing next-generation sequencing (NGS) technology for characterization of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) bacteria. The aim is to detect mutations associated with drug resistance in the context of a surveillance system for tu...berculosis (TB).
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The occurrence of a case of wild polio in a previously polio free area as presently in Syria, whether through importation, laboratory accident, or mutation of vaccine virus (VDPV), should be considered a public health emergency, that requires a rapid and high quality response as utmost priority
Cystic fibrosis (CF) was earlier thought to be a disease prevalent in the West among Caucasians. However, quite a number of recent studies have uncovered CF cases outside of this region, and reported hundreds of unique and novel variant forms of CFTR. Here, we discuss the evidence of CF in parts of... the world earlier considered to be rare; Africa, and Asia. This review also highlighted the CFTR mutation variations and new mutations discovered in these regions. This discovery implies that the CF data from these regions were earlier underestimated. The inadequate awareness of the disease in these regions might have contributed towards the poor diagnostic facilities, under-diagnosis or/and under-reporting, and the lack of CF associated health policies. Overall, these regions have a high rate of infant, childhood and early adulthood mortality due to CF. Therefore, there is a need for a thorough investigation of CF prevalence and to identify unique and novel variant mutations within these regions in order to formulate intervention plans, create awareness, develop mutation specific screening kits and therapies to keep CF mortality at bay.
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Multiple pandemics, numerous outbreaks, thousands of lives lost and billions of dollars of national income wiped out—all since the turn of this century, in barely 17 years—and yet the world’s investments in pandemic preparedness and response remain woefully inadequate. We know by now that the ...world will see another pandemic in the not-too-distant future; that random mutations occur often enough in microbes that help them survive and adapt; that new pathogens will inevitably find a way to break through our defenses; and that there is the increased potential for intentional or accidental release of a synthesized agent. Every expert commentary and every analysis in recent years tells us that the costs of inaction are immense. And yet, as
the havoc caused by the last outbreak turns into a fading memory, we become complacent and relegate the case for investing in preparedness on a back burner, only to bring it to the forefront when the next outbreak occurs. The result is that the world remains scarily vulnerable.
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The Practical manual on laboratory strengthening, 2022 update provides practical guidance on implementation of WHO recommendations and best practices for TB laboratory strengthening. It is an updated version of the GLI Practical Guide to Laboratory Strengthening published in 2017 and provides the la...test practical guidance on use of newly recommended diagnostics as well as guidance in key technical areas, including quality assurance and quality management systems, specimen collection and registration, procurement and supply-chain management, diagnostic connectivity, biosafety, data management, human resources, strategic planning, and model algorithms. The key changes are:
inclusion of recent or updated WHO recommendations for tests to diagnose TB and detect drug resistance;
alignment with the latest WHO critical concentrations for phenotypic drug-susceptibility testing (DST) and the new definitions of pre-XDR-TB and XDR-TB;
updated information on building quality-assured TB testing and management capacity using the Stepwise Laboratory Quality Improvement Process Towards Accreditation (SLIPTA) approach (Score-TB package1);
updated information on assessing, analysing and optimising TB diagnostic networks; and
updated information on the use of next-generation sequencing (NGS) to detect mutations associated with drug resistance for surveillance purposes.
The document also provides references to resources and tools relevant for work on laboratory strengthening.
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Il est plus essentiel que jamais d’assurer un accès équitable aux vaccins contre la COVID-19 pour faire face à l’évolution de la pandémie. Si le virus est éliminé dans certaines régions du monde alors qu’il se propage largement dans d’autres régions, nous courons tous le risque que ...des souches plus fortes apparaissent. Nous ne sommes à l’abri que si tout le monde est à l’abri. Grâce aux notes explicatives de l’OMS sur les vaccins, en savoir plus sur les vaccins, sur leur fonctionnement et sur la façon dont ils sont fabriqués pour en garantir l’innocuité et y permettre un accès équitable.
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Vertreter besorgniserregender Virusvarianten (variants of concern, kurz VOC) wurden weltweit aber auch in Europa, identifiziert. Molekularbiologische Details zu den Varianten sind unter SARS-CoV-2: Virologische Basisdaten und Virusvarianten abrufbar.
n light of the potential risk posed by SARS-CoV-2 variants, in January 2021 WHO organized an ad hoc consultation to discuss the development of an R&D agenda in response to existing and emerging SARS-CoV-2 variants.
The key objectives were to identify the critical research questions related to var...iants and agree on a research approach to address them. Six breakout groups covered a range of specific issues related to COVID-19 variants: Epidemiology and mathematical modelling; evolutionary biology; animal models; assays and diagnostics; clinical management and therapeutics; and vaccines.
This report is a summary of presentations and panel discussions.
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21 Dec 2021. Slideset updated regularly to include the latest data and guidance on COVID-19 vaccines, including implications of emerging SARS-CoV-2 variants